Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms