Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms