Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AUP1Q9Y679 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AUP1Q9Y679 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AUP1Q9Y679 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms