Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FARP1Q9Y4F1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FARP1Q9Y4F1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FARP1Q9Y4F1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FARP1Q9Y4F1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FARP1Q9Y4F1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms