Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y345

SLC6A5, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A5Q9Y345 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A5Q9Y345 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC6A5Q9Y345 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC6A5Q9Y345 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A5Q9Y345 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms