Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH1Q9Y2L9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH1Q9Y2L9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH1Q9Y2L9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH1Q9Y2L9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH1Q9Y2L9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH1Q9Y2L9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH1Q9Y2L9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH1Q9Y2L9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH1Q9Y2L9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH1Q9Y2L9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRCH1Q9Y2L9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRCH1Q9Y2L9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH1Q9Y2L9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH1Q9Y2L9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH1Q9Y2L9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH1Q9Y2L9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH1Q9Y2L9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH1Q9Y2L9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH1Q9Y2L9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH1Q9Y2L9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH1Q9Y2L9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRCH1Q9Y2L9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRCH1Q9Y2L9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH1Q9Y2L9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH1Q9Y2L9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms