Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms