Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
FRMD4BQ9Y2L6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMD4BQ9Y2L6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD4BQ9Y2L6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD4BQ9Y2L6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
FRMD4BQ9Y2L6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms