Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BTRCQ9Y297 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BTRCQ9Y297 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BTRCQ9Y297 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BTRCQ9Y297 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms