Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM33Q9UPN9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM33Q9UPN9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM33Q9UPN9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM33Q9UPN9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM33Q9UPN9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms