Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPK3Q9UPE1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRPK3Q9UPE1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPK3Q9UPE1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPK3Q9UPE1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPK3Q9UPE1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRPK3Q9UPE1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms