Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXW11Q9UKB1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXW11Q9UKB1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXW11Q9UKB1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXW11Q9UKB1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXW11Q9UKB1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXW11Q9UKB1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXW11Q9UKB1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXW11Q9UKB1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXW11Q9UKB1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXW11Q9UKB1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXW11Q9UKB1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXW11Q9UKB1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXW11Q9UKB1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW11Q9UKB1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms