Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK23

NAGPA, N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGPAQ9UK23 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NAGPAQ9UK23 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NAGPAQ9UK23 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NAGPAQ9UK23 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAGPAQ9UK23 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NAGPAQ9UK23 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAGPAQ9UK23 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms