Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC23Q9UJX2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC23Q9UJX2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC23Q9UJX2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC23Q9UJX2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC23Q9UJX2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC23Q9UJX2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC23Q9UJX2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDC23Q9UJX2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC23Q9UJX2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC23Q9UJX2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC23Q9UJX2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms