Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms