Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
KDM5BQ9UGL1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
KDM5BQ9UGL1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
KDM5BQ9UGL1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
KDM5BQ9UGL1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
KDM5BQ9UGL1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
KDM5BQ9UGL1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
KDM5BQ9UGL1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
KDM5BQ9UGL1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
KDM5BQ9UGL1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
KDM5BQ9UGL1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
KDM5BQ9UGL1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.33
KDM5BQ9UGL1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM5BQ9UGL1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
KDM5BQ9UGL1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
KDM5BQ9UGL1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
KDM5BQ9UGL1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
KDM5BQ9UGL1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
KDM5BQ9UGL1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
KDM5BQ9UGL1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
KDM5BQ9UGL1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.94■■■■■ 4.3
KDM5BQ9UGL1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
KDM5BQ9UGL1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
KDM5BQ9UGL1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
KDM5BQ9UGL1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
KDM5BQ9UGL1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
KDM5BQ9UGL1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
KDM5BQ9UGL1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
KDM5BQ9UGL1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
KDM5BQ9UGL1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
KDM5BQ9UGL1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
KDM5BQ9UGL1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM5BQ9UGL1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
KDM5BQ9UGL1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
KDM5BQ9UGL1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM5BQ9UGL1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM5BQ9UGL1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM5BQ9UGL1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
KDM5BQ9UGL1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
KDM5BQ9UGL1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
KDM5BQ9UGL1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
KDM5BQ9UGL1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
KDM5BQ9UGL1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
KDM5BQ9UGL1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
KDM5BQ9UGL1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
KDM5BQ9UGL1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
KDM5BQ9UGL1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
KDM5BQ9UGL1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
KDM5BQ9UGL1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
KDM5BQ9UGL1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
KDM5BQ9UGL1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
KDM5BQ9UGL1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
KDM5BQ9UGL1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
KDM5BQ9UGL1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
KDM5BQ9UGL1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
KDM5BQ9UGL1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KDM5BQ9UGL1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
KDM5BQ9UGL1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
KDM5BQ9UGL1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
KDM5BQ9UGL1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
KDM5BQ9UGL1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
KDM5BQ9UGL1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
KDM5BQ9UGL1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.59■■■■■ 4.25
KDM5BQ9UGL1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
KDM5BQ9UGL1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
KDM5BQ9UGL1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
KDM5BQ9UGL1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
KDM5BQ9UGL1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
KDM5BQ9UGL1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
KDM5BQ9UGL1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
KDM5BQ9UGL1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
KDM5BQ9UGL1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
KDM5BQ9UGL1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
KDM5BQ9UGL1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms