Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NKX1-2Q9UD57 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-2Q9UD57 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX1-2Q9UD57 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-2Q9UD57 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX1-2Q9UD57 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms