Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGSF9Q9P2J2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF9Q9P2J2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IGSF9Q9P2J2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF9Q9P2J2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF9Q9P2J2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms