Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC59Q9P031 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC59Q9P031 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC59Q9P031 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC59Q9P031 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC59Q9P031 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC59Q9P031 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC59Q9P031 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC59Q9P031 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms