Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNIP1Q9NZI2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNIP1Q9NZI2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNIP1Q9NZI2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNIP1Q9NZI2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNIP1Q9NZI2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNIP1Q9NZI2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNIP1Q9NZI2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNIP1Q9NZI2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP1Q9NZI2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNIP1Q9NZI2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms