Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS2

QPCTL, Glutaminyl-peptide cyclotransferase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QPCTLQ9NXS2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
QPCTLQ9NXS2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
QPCTLQ9NXS2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
QPCTLQ9NXS2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
QPCTLQ9NXS2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
QPCTLQ9NXS2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
QPCTLQ9NXS2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
QPCTLQ9NXS2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
QPCTLQ9NXS2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
QPCTLQ9NXS2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
QPCTLQ9NXS2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
QPCTLQ9NXS2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
QPCTLQ9NXS2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
QPCTLQ9NXS2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
QPCTLQ9NXS2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
QPCTLQ9NXS2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
QPCTLQ9NXS2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
QPCTLQ9NXS2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
QPCTLQ9NXS2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms