Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDL2Q9NX52 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL2Q9NX52 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL2Q9NX52 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL2Q9NX52 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL2Q9NX52 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL2Q9NX52 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL2Q9NX52 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL2Q9NX52 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL2Q9NX52 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL2Q9NX52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL2Q9NX52 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL2Q9NX52 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDL2Q9NX52 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL2Q9NX52 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL2Q9NX52 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms