Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX24

NHP2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2Q9NX24 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHP2Q9NX24 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHP2Q9NX24 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHP2Q9NX24 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHP2Q9NX24 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHP2Q9NX24 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHP2Q9NX24 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHP2Q9NX24 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHP2Q9NX24 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHP2Q9NX24 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHP2Q9NX24 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHP2Q9NX24 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHP2Q9NX24 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms