Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A9Q9NUM3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A9Q9NUM3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLC39A9Q9NUM3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A9Q9NUM3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms