Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPPQ9NTK1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPPQ9NTK1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPPQ9NTK1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPPQ9NTK1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPPQ9NTK1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPPQ9NTK1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPPQ9NTK1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPPQ9NTK1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPPQ9NTK1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEPPQ9NTK1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DEPPQ9NTK1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPPQ9NTK1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPPQ9NTK1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPPQ9NTK1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPPQ9NTK1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPPQ9NTK1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPPQ9NTK1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPPQ9NTK1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPPQ9NTK1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPPQ9NTK1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPPQ9NTK1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms