Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPMQ9NSP4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPMQ9NSP4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPMQ9NSP4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPMQ9NSP4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPMQ9NSP4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPMQ9NSP4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPMQ9NSP4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPMQ9NSP4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPMQ9NSP4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPMQ9NSP4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPMQ9NSP4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPMQ9NSP4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPMQ9NSP4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms