Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SALL1Q9NSC2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SALL1Q9NSC2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SALL1Q9NSC2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SALL1Q9NSC2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SALL1Q9NSC2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SALL1Q9NSC2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SALL1Q9NSC2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms