Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIT2Q9NQR4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIT2Q9NQR4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIT2Q9NQR4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NIT2Q9NQR4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIT2Q9NQR4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms