Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PFDN4Q9NQP4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFDN4Q9NQP4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFDN4Q9NQP4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFDN4Q9NQP4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms