Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COPS7BQ9H9Q2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPS7BQ9H9Q2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS7BQ9H9Q2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS7BQ9H9Q2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms