Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVMER34-1Q9H9K5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVMER34-1Q9H9K5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVMER34-1Q9H9K5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVMER34-1Q9H9K5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVMER34-1Q9H9K5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVMER34-1Q9H9K5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms