Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SCAF1Q9H7N4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SCAF1Q9H7N4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC38.76■■■■□ 3.79
SCAF1Q9H7N4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SCAF1Q9H7N4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SCAF1Q9H7N4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SCAF1Q9H7N4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SCAF1Q9H7N4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SCAF1Q9H7N4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SCAF1Q9H7N4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SCAF1Q9H7N4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SCAF1Q9H7N4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SCAF1Q9H7N4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
SCAF1Q9H7N4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SCAF1Q9H7N4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
SCAF1Q9H7N4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
SCAF1Q9H7N4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
SCAF1Q9H7N4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SCAF1Q9H7N4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SCAF1Q9H7N4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SCAF1Q9H7N4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SCAF1Q9H7N4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAF1Q9H7N4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAF1Q9H7N4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAF1Q9H7N4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAF1Q9H7N4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SCAF1Q9H7N4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SCAF1Q9H7N4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SCAF1Q9H7N4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
SCAF1Q9H7N4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SCAF1Q9H7N4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SCAF1Q9H7N4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SCAF1Q9H7N4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SCAF1Q9H7N4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SCAF1Q9H7N4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAF1Q9H7N4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SCAF1Q9H7N4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SCAF1Q9H7N4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SCAF1Q9H7N4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SCAF1Q9H7N4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SCAF1Q9H7N4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
SCAF1Q9H7N4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
SCAF1Q9H7N4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SCAF1Q9H7N4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SCAF1Q9H7N4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SCAF1Q9H7N4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SCAF1Q9H7N4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SCAF1Q9H7N4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SCAF1Q9H7N4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SCAF1Q9H7N4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SCAF1Q9H7N4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SCAF1Q9H7N4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SCAF1Q9H7N4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAF1Q9H7N4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms