Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Z4

RANBP3, Ran-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP3Q9H6Z4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP3Q9H6Z4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANBP3Q9H6Z4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANBP3Q9H6Z4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP3Q9H6Z4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms