Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARLQ9H300 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PARLQ9H300 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PARLQ9H300 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PARLQ9H300 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PARLQ9H300 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PARLQ9H300 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PARLQ9H300 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PARLQ9H300 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PARLQ9H300 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARLQ9H300 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARLQ9H300 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PARLQ9H300 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms