Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1A7

POLR2J3, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3Q9H1A7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2J3Q9H1A7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2J3Q9H1A7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR2J3Q9H1A7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2J3Q9H1A7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2J3Q9H1A7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2J3Q9H1A7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2J3Q9H1A7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2J3Q9H1A7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2J3Q9H1A7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2J3Q9H1A7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2J3Q9H1A7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2J3Q9H1A7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms