Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPEF2Q9C093 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPEF2Q9C093 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPEF2Q9C093 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPEF2Q9C093 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPEF2Q9C093 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPEF2Q9C093 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPEF2Q9C093 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPEF2Q9C093 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPEF2Q9C093 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPEF2Q9C093 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SPEF2Q9C093 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SPEF2Q9C093 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SPEF2Q9C093 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SPEF2Q9C093 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SPEF2Q9C093 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SPEF2Q9C093 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SPEF2Q9C093 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms