Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM15Q9C019 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM15Q9C019 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM15Q9C019 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM15Q9C019 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM15Q9C019 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM15Q9C019 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM15Q9C019 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM15Q9C019 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM15Q9C019 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM15Q9C019 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM15Q9C019 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM15Q9C019 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM15Q9C019 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM15Q9C019 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM15Q9C019 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms