Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROPN1BQ9BZX4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROPN1BQ9BZX4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROPN1BQ9BZX4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROPN1BQ9BZX4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ROPN1BQ9BZX4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROPN1BQ9BZX4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ROPN1BQ9BZX4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ROPN1BQ9BZX4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ROPN1BQ9BZX4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms