Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFIH1Q9BYX4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFIH1Q9BYX4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFIH1Q9BYX4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFIH1Q9BYX4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
IFIH1Q9BYX4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms