Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL1Q9BYD6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL1Q9BYD6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL1Q9BYD6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL1Q9BYD6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL1Q9BYD6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms