Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLDIP3Q9BY77 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLDIP3Q9BY77 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLDIP3Q9BY77 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLDIP3Q9BY77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLDIP3Q9BY77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms