Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGR4Q9BXB1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LGR4Q9BXB1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LGR4Q9BXB1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LGR4Q9BXB1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LGR4Q9BXB1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGR4Q9BXB1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LGR4Q9BXB1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms