Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PBDC1Q9BVG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PBDC1Q9BVG4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PBDC1Q9BVG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PBDC1Q9BVG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms