Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL8

PDCD10, Programmed cell death protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD10Q9BUL8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD10Q9BUL8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD10Q9BUL8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PDCD10Q9BUL8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD10Q9BUL8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms