Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC1Q9BTX1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDC1Q9BTX1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDC1Q9BTX1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDC1Q9BTX1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDC1Q9BTX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDC1Q9BTX1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDC1Q9BTX1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDC1Q9BTX1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDC1Q9BTX1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NDC1Q9BTX1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDC1Q9BTX1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDC1Q9BTX1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NDC1Q9BTX1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDC1Q9BTX1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms