Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.313e-16■■■■■ 41.5
BUD13Q9BRD0 KDM3A-207ENST00000462197 448 ntTSL 32.51□□□□□ -2.016e-9■■■■■ 41.5
BUD13Q9BRD0 FURIN-203ENST00000559353 587 ntTSL 318.35■□□□□ 0.532e-11■■■■■ 41.3
BUD13Q9BRD0 NCKIPSD-206ENST00000439518 1214 ntTSL 1 (best)23.62■■□□□ 1.379e-8■■■■■ 41.1
BUD13Q9BRD0 NCKIPSD-208ENST00000454134 998 ntTSL 319.06■□□□□ 0.649e-8■■■■■ 41.1
BUD13Q9BRD0 NCKIPSD-205ENST00000426678 897 ntTSL 516.61■□□□□ 0.259e-8■■■■■ 41.1
BUD13Q9BRD0 NCKIPSD-207ENST00000453349 889 ntTSL 316.18■□□□□ 0.189e-8■■■■■ 41.1
BUD13Q9BRD0 GPI-210ENST00000589504 536 ntTSL 220.33■□□□□ 0.854e-9■■■■■ 40.6
BUD13Q9BRD0 GPI-214ENST00000590375 529 ntTSL 419.6■□□□□ 0.734e-9■■■■■ 40.6
BUD13Q9BRD0 CHST15-204ENST00000476765 436 ntTSL 38.78□□□□□ -12e-12■■■■■ 40.5
BUD13Q9BRD0 BHLHE40-203ENST00000467610 1366 ntTSL 219.67■□□□□ 0.746e-12■■■■■ 40.5
BUD13Q9BRD0 RELT-205ENST00000544075 744 ntTSL 325.17■■□□□ 1.621e-7■■■■■ 40.4
BUD13Q9BRD0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 40.4
BUD13Q9BRD0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 40.4
BUD13Q9BRD0 RELT-207ENST00000545886 4346 ntTSL 214.71□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 40.4
BUD13Q9BRD0 TMEM94-207ENST00000578624 583 ntTSL 414.47□□□□□ -0.099e-10■■■■■ 40.4
BUD13Q9BRD0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.463e-9■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 AES-203ENST00000585557 491 ntTSL 532.73■■■□□ 2.833e-9■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.442e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 KMT5C-202ENST00000402499 888 ntTSL 226.8■■□□□ 1.882e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 KMT5C-208ENST00000498738 713 ntTSL 525.68■■□□□ 1.74e-12■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.623e-9■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 SEPT7-216ENST00000635172 509 ntTSL 224.69■■□□□ 1.542e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 SEPT7-219ENST00000635476 506 ntTSL 524.69■■□□□ 1.542e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.32e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 GRINA-205ENST00000529301 1075 ntTSL 322.76■■□□□ 1.232e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.122e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 CMAS-202ENST00000534981 1575 ntTSL 1 (best)21.61■■□□□ 1.052e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 CMAS-203ENST00000535610 854 ntTSL 521.54■■□□□ 1.042e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 COPS7B-211ENST00000432387 584 ntTSL 421.11■□□□□ 0.972e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 COPS7B-215ENST00000450501 559 ntTSL 421.06■□□□□ 0.962e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 320.89■□□□□ 0.943e-9■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 KMT5C-210ENST00000589338 1601 ntTSL 1 (best)20.7■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 UPF3A-203ENST00000474056 748 ntTSL 320.63■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 AES-210ENST00000590067 1100 ntTSL 220.36■□□□□ 0.854e-9■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.762e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.682e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 KMT5C-205ENST00000464185 2235 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 GRINA-206ENST00000530898 558 ntTSL 218.21■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 COPS7B-202ENST00000357490 563 ntTSL 418.1■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 UPF3A-208ENST00000484246 699 ntTSL 317.85■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 SLC51A-208ENST00000475271 766 ntTSL 217.49■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 AES-209ENST00000587393 1082 ntTSL 217.47■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 IMPAD1-202ENST00000517461 487 ntTSL 517.39■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 RBM22-206ENST00000521464 731 ntTSL 416.5■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 KIAA1468-206ENST00000587725 3268 ntTSL 215.96■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 CHD3-207ENST00000466233 648 ntTSL 415.91■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 CHD3-209ENST00000473376 562 ntTSL 215.91■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 SLC51A-204ENST00000428985 636 ntTSL 315.72■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -02e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 SLC51A-212ENST00000484407 1066 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 AES-208ENST00000587083 458 ntTSL 214.38□□□□□ -0.114e-9■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 UPF3A-210ENST00000493727 937 ntTSL 514□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 HERC1-202ENST00000558324 828 ntTSL 513.81□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 MPDZ-206ENST00000437441 581 ntTSL 513.61□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 AES-212ENST00000592414 3274 ntTSL 213.4□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 GATA4-202ENST00000526021 1064 ntTSL 213.26□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 KIF2C-207ENST00000480574 783 ntTSL 512.69□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 SLC51A-209ENST00000475672 1208 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 HNRNPU-221ENST00000639824 1450 ntTSL 512.23□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 PARP16-205ENST00000560149 823 ntTSL 512.14□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 RBM22-207ENST00000521594 566 ntTSL 412.12□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 SPATA13-210ENST00000474317 529 ntTSL 211.71□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 CHD3-208ENST00000470531 3744 ntTSL 211.54□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 MRPL15-202ENST00000519831 601 ntTSL 211.53□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 UBE2F-210ENST00000434137 472 ntTSL 511.5□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 HERC1-212ENST00000561348 588 ntTSL 211.45□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 UBE2F-211ENST00000434655 648 ntTSL 510.54□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 POLD3-201ENST00000263681 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 PARP16-204ENST00000559805 678 ntTSL 29.16□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 MPDZ-217ENST00000542806 2385 ntTSL 29.1□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 RBM22-203ENST00000518917 566 ntTSL 58.89□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 COPS7B-218ENST00000466901 598 ntTSL 38.86□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.071e-15■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 UPF3A-207ENST00000481131 678 ntTSL 38.12□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 UPF3A-205ENST00000479712 423 ntTSL 27.98□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 KIAA1468-208ENST00000588446 764 ntTSL 27.81□□□□□ -1.162e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 RBM22-205ENST00000521248 660 ntTSL 27.66□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 MPDZ-207ENST00000438511 2303 ntTSL 27.54□□□□□ -1.22e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 MRPL15-203ENST00000522521 853 ntTSL 56.77□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 RBM22-208ENST00000522469 989 ntTSL 26.29□□□□□ -1.42e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 ELP3-214ENST00000522063 563 ntTSL 56.2□□□□□ -1.422e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 SEPT7-211ENST00000493626 643 ntTSL 45.98□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 SEPT7-220ENST00000635669 569 ntTSL 45.61□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 LRIG2-202ENST00000466069 564 ntTSL 25.54□□□□□ -1.521e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.532e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 AES-211ENST00000592330 275 ntTSL 55.22□□□□□ -1.573e-9■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 LRIG2-204ENST00000470000 365 ntTSL 25.13□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 40.2
BUD13Q9BRD0 ABCA7-212ENST00000530092 571 ntTSL 420.82■□□□□ 0.924e-8■■■■■ 40.1
BUD13Q9BRD0 GAPDH-210ENST00000496049 390 ntTSL 216.34■□□□□ 0.218e-27■■■■■ 40.1
BUD13Q9BRD0 CKB-203ENST00000553610 542 ntTSL 319.69■□□□□ 0.741e-10■■■■■ 40.1
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 6389.5 ms