Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF18Q99633 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF18Q99633 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF18Q99633 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms