Protein–RNA interactions for Protein: Q99527

GPER1, G-protein coupled estrogen receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPER1Q99527 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPER1Q99527 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPER1Q99527 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPER1Q99527 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms