Protein–RNA interactions for Protein: Q99325

ATG40, Autophagy-related protein 40, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG40Q99325 MRS6YOR370C 1812 nt7.44□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 YHR219WYHR219W 1875 nt7.44□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 FUN14YAL008W 597 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 YPR126CYPR126C 309 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 VMA11YPL234C 495 nt7.42□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 RPD3YNL330C 1302 nt7.42□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 SSL2YIL143C 2532 nt7.42□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 ADE8YDR408C 645 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 YEL008WYEL008W 381 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 ODC1YPL134C 933 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 SAC7YDR389W 1965 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 KRR1YCL059C 951 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 YJR114WYJR114W 393 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG40Q99325 ITR2YOL103W 1830 nt7.39□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 HXK1YFR053C 1458 nt7.39□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 SNZ1YMR096W 894 nt7.39□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 IML3YBR107C 738 nt7.39□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 LSR1LSR1 1175 nt7.38□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 YNR064CYNR064C 873 nt7.38□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 TIP1YBR067C 633 nt7.37□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 THI72YOR192C 1800 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 TVP23YDR084C 600 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 TIM44YIL022W 1296 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 MDM35YKL053C-A 261 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 ALD5YER073W 1563 nt7.35□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 SPS100YHR139C 981 nt7.35□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 MHF1YOL086W-A 273 nt7.35□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 YOR072WYOR072W 315 nt7.35□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 CTI6YPL181W 1521 nt7.34□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 TAF13YML098W 504 nt7.34□□□□□ -1.23
ATG40Q99325 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 RPN14YGL004C 1254 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 OPI3YJR073C 621 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 YMR262WYMR262W 942 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 SNX3YOR357C 489 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 GTB1YDR221W 2109 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 YMR265CYMR265C 1386 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 KEL3YPL263C 1956 nt7.32□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 ILV2YMR108W 2064 nt7.31□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 HAP5YOR358W 729 nt7.31□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 YIL177CYIL177C 5277 nt7.31□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 YHR218WYHR218W 1812 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 ELO1YJL196C 933 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 RPC31YNL151C 756 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 STE4YOR212W 1272 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 snR31snR31 225 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 PCP1YGR101W 1041 nt7.29□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 ABZ2YMR289W 1125 nt7.29□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 POT1YIL160C 1254 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 RIM2YBR192W 1134 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 ESBP6YNL125C 2022 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG40Q99325 HXT10YFL011W 1641 nt7.27□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 SUV3YPL029W 2214 nt7.26□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 FRE6YLL051C 2139 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 CPD1YGR247W 720 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 YLR349WYLR349W 507 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 SWT21YNL187W 1074 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 AMF1YOR378W 1548 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 GSF2YML048W 1212 nt7.23□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 GAL2YLR081W 1725 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 INH1YDL181W 258 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 DPL1YDR294C 1770 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 ENO2YHR174W 1314 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG40Q99325 TUB4YLR212C 1422 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 SFL1YOR140W 2301 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 CRC1YOR100C 984 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 MET1YKR069W 1782 nt7.19□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 AGP3YFL055W 1677 nt7.18□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 MEX67YPL169C 1800 nt7.17□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 LEU2YCL018W 1095 nt7.17□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 NBA1YOL070C 1506 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 DTR1YBR180W 1719 nt7.15□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 LEU4YNL104C 1860 nt7.15□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 ADH7YCR105W 1086 nt7.15□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 YDR467CYDR467C 327 nt7.15□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 NIF3YGL221C 867 nt7.15□□□□□ -1.26
ATG40Q99325 TPC1YGR096W 945 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 FSH2YMR222C 672 nt7.13□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 KGD2YDR148C 1392 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 SBP1YHL034C 885 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 APS2YJR058C 444 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 YKL053WYKL053W 375 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 BSP1YPR171W 1731 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 MTO1YGL236C 2010 nt7.11□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 SAN1YDR143C 1833 nt7.11□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 PAU15YIR041W 375 nt7.11□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 TOK1YJL093C 2076 nt7.11□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 RAD51YER095W 1203 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 GPM1YKL152C 744 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 KRE1YNL322C 942 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 NAM8YHR086W 1572 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 RFC1YOR217W 2586 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 SRP54YPR088C 1626 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 PAR32YDL173W 888 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG40Q99325 STP3YLR375W 1032 nt7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.5 ms