Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF3RQ99062 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSF3RQ99062 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF3RQ99062 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF3RQ99062 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms