Protein–RNA interactions for Protein: Q96T58

SPEN, Msx2-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPENQ96T58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPENQ96T58 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPENQ96T58 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPENQ96T58 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPENQ96T58 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPENQ96T58 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms